Berliini vuonna 1929: Sykkivän suurkaupungin ihmiset elävät uudenlaisen vapauden aikakautta, jossa moraalisäännöillä on vain vähän sijaa. Politiikassa kuohuu, mikä näkyy kaduilla kommunistien ja natsien rettelöintinä.

Kun Spreejoesta löydetään tunnistamaton, kuoliaaksi kidutetun miehen ruumis, komisario Gereon Rath värvätään murharyhmän tutkimuksiin. Ne vievät hänet emigranttivenäläisten piireihin, kullan, huumeiden ja aseiden salakuljetuksen jäljille. Rath myös tutustuu – ja rakastuu – murharyhmän sihteeriin Charlyyn, joka osoittautuu vähintään yhtä päteväksi rikostutkijaksi kuin varsinaiset etsivätkin. Rathin uppoutuessa yhä syvemmälle rikosten, korruption ja poliittisten salajuonien maailmaan hänestä itsestään tulee murhaepäilty.

Babylon Berlin kertoo omapäisestä etsivästä Berliinin alamaailman kuohuissa ja herättää henkiin menneen maailman metropolin, joka kiivaudessaan ja värikkyydessään vaikuttaa hämmästyttävän modernilta.