Vanginkuljetusauto suistuu ulos tieltä. Autosta selviää ulos yksinäinen vanki Murphy Pendleton, Silent Hillin kaupungin kupeesta. Pendletonin tutustuessa ympäristöönsä, hänelle valkenee asioiden todellinen luonne. Kaikki ei olekaan normaalilla mallillaan tässä kylässä.

Luvassa on aivot nyrjäyttäviä pulmia, luonnottomia hirviöitä ja kauhuja tämän maailman ulkopuolelta. Aseinaan vain arkisia kapistuksia, puutuoleista lasipulloihin, joilla pitää viholliset kaukana, on pelaajan valinta jäädänkö taistelemaan vaiko paeta. Kiehtova ja synkkä kauhutarina vie pelaajat Silent Hillin klassisen kauhumaailman pariin perinteitä noudattavalla tavalla.