Mass Effect -trilogia seuraa Komenteja Shepardin kasvua Alliance Marine -sotilaasta galaksin parhaaksi sotilaaksi - ainoaksi, joka pystyy johtamaan galaksien välistä sotaa Reapers-rotua vastaan. Peli yhdistää sykähdyttävän toiminnan interaktiiviseen ja tunteisiin vetoavaan tarinaan, jossa pelaaja päättää miten tarina kehittyy läpi kaikkien kolmen pelin. Luottosotilaat rinnallaan pelaajat päättävät miten galaksi pelastetaan, mitä aseita käytetään ja mitä kaikkia kumppanuuksia hyödynnetään tai murskataan.