A an?lise da diversidade de micro-organismos dos diversos ambientes encontra-se em evid?ncia, uma vez que, progressivamente, os genomas s?o sequenciados e publicados. O conhecimento da biodiversidade e a bioprospec??o tornaram-se focos importantes da biotecnologia, pois, no cen?rio mundial, cresce a utiliza??o dos micro-organismos na busca por solu??es para as diversas ?reas. A an?lise da comunidade de micro-organismos de um ambiente por t?cnicas que dispensam a etapa de cultivo inicia-se com a extra??o de DNA total diretamente do material coletado, o que permite o acesso a genes de esp?cies ainda n?o cultivadas e, assim, a identifica??o microbiol?gica. O gene 16S rDNA ? o mais utilizado, fornecendo uma vis?o geral da composi??o da comunidade por estar presente em todos os procariontes. Este estudo analisou, atrav?s do sequenciamento parcial dos genes 16S rDNA, a diversidade microbiana de solos amaz?nicos. Tal abordagem pode ser aplicada para estudar os diversos microbiomas em diferentes condi??es.